Ну, в этом может быть какая-нибудь логика. Техногенная катастрофа на LV-223, ведь, как раз пару тысячелетий назад произошла, и с тех пор Инженеры Землю не посещали и не привносили свою культуру. А с тех времён, как контакт прекратился, развитие людей ушло по пути отличному от Инженеров.
Там же ещё есть тема, затронутая в Прометее, о превосходстве созданиями своих создателей. Возможно, люди превосходят Инженеров. Как, в свою очередь, Дэвид превзошёл людей. А в конце этой цепочки создание создания создателей создаёт совершенное существо, превосходящее их всех, — ксеноморфа/ультраморфа.