В Чужих именно Берк послал колонистов расследовать дереликт, и именно он хотел протащить пришельцев через карантин, то есть как бы без ведома компании, а если и под контролем, то как-то без поддержки. Ну то есть, вот ситуация, рыщут они в поисках ксеноморфов по всей галактике, и тут Рипли заявляет - на Ахероне лежит корабль с яйцами, и как бы ничего, экспедиции не снаряжают, никаких действий, Рипли себе работает где-то, мучается кошмарами, и только Берк додумался послать нескольких колонистов проверить, видимо не очень-то нужны компании эти ксеноморфы.
Просто Кэмерон решил проигнорировать "осведомленность компании обо всем на свете", когда писал сценарий, ну потому что оно видимо так вот писалось хорошо, и начинать концы связывать и логику пытаться сохранить как-то было лень.